Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BMP3P12645 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BMP3P12645 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BMP3P12645 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BMP3P12645 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BMP3P12645 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BMP3P12645 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BMP3P12645 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BMP3P12645 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BMP3P12645 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BMP3P12645 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BMP3P12645 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BMP3P12645 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BMP3P12645 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BMP3P12645 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BMP3P12645 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BMP3P12645 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BMP3P12645 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BMP3P12645 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BMP3P12645 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BMP3P12645 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BMP3P12645 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BMP3P12645 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BMP3P12645 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BMP3P12645 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BMP3P12645 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BMP3P12645 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP3P12645 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP3P12645 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP3P12645 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BMP3P12645 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BMP3P12645 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BMP3P12645 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BMP3P12645 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BMP3P12645 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BMP3P12645 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BMP3P12645 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BMP3P12645 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BMP3P12645 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BMP3P12645 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BMP3P12645 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BMP3P12645 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BMP3P12645 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BMP3P12645 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BMP3P12645 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BMP3P12645 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BMP3P12645 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BMP3P12645 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BMP3P12645 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BMP3P12645 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms