Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF888P0CJ79 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms