Protein–RNA interactions for Protein: P03980

Ig heavy chain V region TEPC 1017, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03980 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P03980 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P03980 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P03980 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03980 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03980 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03980 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03980 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03980 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03980 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03980 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03980 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P03980 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03980 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03980 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03980 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03980 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03980 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03980 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03980 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03980 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03980 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P03980 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03980 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03980 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03980 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03980 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03980 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03980 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03980 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03980 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P03980 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P03980 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P03980 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P03980 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P03980 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P03980 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P03980 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P03980 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P03980 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P03980 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03980 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03980 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03980 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03980 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03980 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03980 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P03980 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P03980 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03980 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03980 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03980 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03980 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03980 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03980 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03980 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03980 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03980 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P03980 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03980 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03980 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03980 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P03980 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms