Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc1P02468 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc1P02468 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc1P02468 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms