Protein–RNA interactions for Protein: P01904

H2-Ea, H-2 class II histocompatibility antigen, E-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-EaP01904 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-EaP01904 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-EaP01904 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms