Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sypl2O89104 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 421.2 ms