Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DcxO88809 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DcxO88809 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DcxO88809 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DcxO88809 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DcxO88809 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DcxO88809 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DcxO88809 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DcxO88809 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DcxO88809 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DcxO88809 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DcxO88809 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DcxO88809 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DcxO88809 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DcxO88809 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DcxO88809 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DcxO88809 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DcxO88809 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DcxO88809 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DcxO88809 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DcxO88809 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DcxO88809 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DcxO88809 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DcxO88809 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DcxO88809 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DcxO88809 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DcxO88809 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DcxO88809 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DcxO88809 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DcxO88809 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DcxO88809 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DcxO88809 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DcxO88809 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DcxO88809 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DcxO88809 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DcxO88809 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DcxO88809 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DcxO88809 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DcxO88809 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DcxO88809 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DcxO88809 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DcxO88809 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DcxO88809 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DcxO88809 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DcxO88809 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DcxO88809 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DcxO88809 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DcxO88809 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DcxO88809 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DcxO88809 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DcxO88809 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DcxO88809 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DcxO88809 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DcxO88809 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DcxO88809 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DcxO88809 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DcxO88809 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DcxO88809 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DcxO88809 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DcxO88809 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DcxO88809 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DcxO88809 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DcxO88809 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DcxO88809 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DcxO88809 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DcxO88809 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DcxO88809 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DcxO88809 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DcxO88809 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DcxO88809 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DcxO88809 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DcxO88809 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DcxO88809 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DcxO88809 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DcxO88809 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DcxO88809 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DcxO88809 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DcxO88809 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DcxO88809 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms