Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNSO60931 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNSO60931 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNSO60931 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNSO60931 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNSO60931 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNSO60931 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNSO60931 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNSO60931 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNSO60931 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNSO60931 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNSO60931 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNSO60931 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNSO60931 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNSO60931 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNSO60931 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNSO60931 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNSO60931 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNSO60931 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNSO60931 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNSO60931 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNSO60931 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNSO60931 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNSO60931 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNSO60931 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNSO60931 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms