Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabep1O35551 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabep1O35551 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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