Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-ObO35424 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms