Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP290O15078 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP290O15078 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP290O15078 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP290O15078 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP290O15078 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP290O15078 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP290O15078 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP290O15078 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CEP290O15078 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP290O15078 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP290O15078 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP290O15078 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP290O15078 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP290O15078 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP290O15078 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP290O15078 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP290O15078 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP290O15078 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP290O15078 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP290O15078 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP290O15078 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP290O15078 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP290O15078 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP290O15078 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP290O15078 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP290O15078 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP290O15078 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP290O15078 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP290O15078 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP290O15078 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP290O15078 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP290O15078 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP290O15078 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP290O15078 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP290O15078 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP290O15078 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP290O15078 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP290O15078 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP290O15078 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP290O15078 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP290O15078 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP290O15078 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP290O15078 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP290O15078 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP290O15078 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP290O15078 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP290O15078 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP290O15078 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP290O15078 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP290O15078 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP290O15078 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP290O15078 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP290O15078 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP290O15078 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP290O15078 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP290O15078 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP290O15078 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP290O15078 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP290O15078 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP290O15078 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP290O15078 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP290O15078 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP290O15078 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP290O15078 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP290O15078 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP290O15078 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP290O15078 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP290O15078 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP290O15078 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP290O15078 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP290O15078 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP290O15078 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP290O15078 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP290O15078 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP290O15078 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP290O15078 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP290O15078 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP290O15078 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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