Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac1O09106 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac1O09106 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms