Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3488M0QW81 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3488M0QW81 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3488M0QW81 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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