Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vwa3bJ9JI28 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vwa3bJ9JI28 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vwa3bJ9JI28 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms