Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC37.45■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Ccdc180J3QNE4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ccdc180J3QNE4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms