Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc4lG5E8X2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc4lG5E8X2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms