Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Obox6G3X9U1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Obox6G3X9U1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox6G3X9U1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms