Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colca2F8VPY8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Colca2F8VPY8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Colca2F8VPY8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Colca2F8VPY8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Colca2F8VPY8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Colca2F8VPY8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Colca2F8VPY8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Colca2F8VPY8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms