Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21977F6U3N7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms