Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM227AF5H4B4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms