Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
2610001J05RikF2Z3Y9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610001J05RikF2Z3Y9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms