Protein–RNA interactions for Protein: E9Q346

Vmn1r160, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r160E9Q346 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r160E9Q346 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r160E9Q346 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms