Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trappc8E9PWG2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trappc8E9PWG2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Trappc8E9PWG2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms