Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt2E9PUL5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms