Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Catsperg2C6KI89 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Catsperg2C6KI89 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms