Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apba1B2RUJ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apba1B2RUJ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms