Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms