Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf1B2RRD7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brpf1B2RRD7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms