Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm436B1AVU6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm436B1AVU6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm436B1AVU6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms