Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox1B1APN4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms