Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd4A2AKM2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hacd4A2AKM2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms