Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc27A2A6Q5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms