Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv30A0A0B4J1P1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv30A0A0B4J1P1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms