Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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