Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 IGF2BP1-206ENST00000515586 768 ntTSL 312.05□□□□□ -0.486e-14■□□□□ 8.2
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SF3A3Q12874 SSR4-211ENST00000486204 658 ntTSL 311.78□□□□□ -0.521e-16■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.537e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-222ENST00000494153 757 ntTSL 511.58□□□□□ -0.567e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 IGF2BP1-204ENST00000505562 461 ntTSL 311.54□□□□□ -0.566e-14■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-203ENST00000343255 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.567e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-221ENST00000493364 372 ntTSL 211.28□□□□□ -0.67e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-211ENST00000468559 675 ntTSL 511.05□□□□□ -0.647e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-214ENST00000492112 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.657e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 IGF2BP1-203ENST00000499130 568 ntTSL 310.31□□□□□ -0.766e-14■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SSR4-210ENST00000485612 701 ntTSL 210.17□□□□□ -0.781e-16■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-204ENST00000344989 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.797e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-212ENST00000469097 801 ntTSL 59.49□□□□□ -0.897e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-215ENST00000474466 440 ntTSL 39.39□□□□□ -0.917e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-207ENST00000453840 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.967e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.967e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-214ENST00000472128 865 ntTSL 58.79□□□□□ -17e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 JTB-204ENST00000428469 520 ntTSL 38.51□□□□□ -1.057e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-206ENST00000374453 866 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.187e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-210ENST00000473858 778 ntTSL 27.6□□□□□ -1.197e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SRSF10-215ENST00000495785 1390 ntTSL 56.15□□□□□ -1.437e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 HM13-225ENST00000619859 455 ntTSL 35.8□□□□□ -1.487e-7■□□□□ 8.2
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SF3A3Q12874 SRSF10-208ENST00000469303 413 ntTSL 33.47□□□□□ -1.857e-7■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-10■□□□□ 8.2
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SF3A3Q12874 FGFR4-205ENST00000430285 713 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.021e-33■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.143e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 FTH1-206ENST00000530019 550 ntTSL 414.18□□□□□ -0.143e-11■□□□□ 8.2
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SF3A3Q12874 FTH1-211ENST00000534719 788 ntTSL 1 (best)12.05□□□□□ -0.483e-11■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 FTH1-210ENST00000534180 983 ntTSL 211.84□□□□□ -0.513e-11■□□□□ 8.2
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SF3A3Q12874 FTH1-209ENST00000533138 885 ntTSL 510.05□□□□□ -0.83e-11■□□□□ 8.2
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SF3A3Q12874 IGF2BP3-205ENST00000467592 600 ntTSL 52.34□□□□□ -2.032e-6■□□□□ 8.2
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SF3A3Q12874 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.56□□□□□ -1.521e-323■□□□□ 8.2
SF3A3Q12874 CCNB1IP1-211ENST00000555348 505 ntTSL 43.08□□□□□ -1.921e-323■□□□□ 8.2
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SF3A3Q12874 ATF7IP2-207ENST00000561932 538 ntTSL 412.95□□□□□ -0.342e-15■□□□□ 8.1
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SF3A3Q12874 OXA1L-206ENST00000473744 824 ntTSL 310.06□□□□□ -0.88e-42■□□□□ 8.1
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SF3A3Q12874 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.46e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.066e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.646e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 MOGS-204ENST00000448666 1616 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.596e-8■□□□□ 8.1
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SF3A3Q12874 GPI-209ENST00000589399 565 ntTSL 516.05■□□□□ 0.166e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 MOGS-207ENST00000462443 532 ntTSL 215.99■□□□□ 0.156e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 GPI-211ENST00000589640 571 ntTSL 415.58■□□□□ 0.086e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 MOGS-206ENST00000462189 2400 ntTSL 214.76□□□□□ -0.056e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 NFE2L2-210ENST00000462023 521 ntTSL 213.67□□□□□ -0.226e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 MOGS-203ENST00000414701 520 ntTSL 312.91□□□□□ -0.346e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 ABCD4-204ENST00000466822 520 ntTSL 212.84□□□□□ -0.356e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 GPI-215ENST00000591204 559 ntTSL 48.86□□□□□ -0.996e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 MOGS-209ENST00000489655 489 ntTSL 36.36□□□□□ -1.396e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 PAH-218ENST00000635528 960 ntTSL 34.96□□□□□ -1.622e-19■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 PRKDC-210ENST00000541488 719 ntTSL 34.35□□□□□ -1.716e-8■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 HECTD1-217ENST00000557369 554 ntTSL 44.55□□□□□ -1.687e-17■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 RPL7A-205ENST00000468019 941 ntTSL 211.74□□□□□ -0.536e-32■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 RPL7A-207ENST00000489392 966 ntTSL 59.38□□□□□ -0.916e-32■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.016e-32■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.426e-32■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 RPL7A-204ENST00000463740 1164 ntTSL 56.01□□□□□ -1.456e-32■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)6.01□□□□□ -1.456e-32■□□□□ 8.1
SF3A3Q12874 SLC39A13-210ENST00000531419 785 ntTSL 518.71■□□□□ 0.595e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.585e-6■□□□□ 8
SF3A3Q12874 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.545e-6■□□□□ 8
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