Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LYVE1Q9Y5Y7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms