Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRP12Q9Y561 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms