Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLXND1Q9Y4D7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms