Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec2Q9WV35 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec2Q9WV35 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec2Q9WV35 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec2Q9WV35 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec2Q9WV35 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec2Q9WV35 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec2Q9WV35 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec2Q9WV35 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms