Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stub1Q9WUD1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stub1Q9WUD1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms