Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv2Q9WTR1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trpv2Q9WTR1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv2Q9WTR1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms