Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms