Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syt6Q9R0N8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt6Q9R0N8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms