Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsfQ9R013 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsfQ9R013 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsfQ9R013 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms