Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm4Q9QXA5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms