Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms