Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDP1Q9P0J1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDP1Q9P0J1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms