Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TMOD3Q9NYL9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD3Q9NYL9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD3Q9NYL9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms