Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZDHHC3Q9NYG2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms