Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF19Q9NS68 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF19Q9NS68 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms